Autoagresija - poznata i kao autoalergija - rezultat je reakcije tijela na obrambu protiv antigena vlastitih stanica. Drugim riječima, tijelo smatra da su vlastite stanice i tkiva neprijateljski raspoložene prema njima te koristi svoj imunološki sustav da ih uništi. Rezultat su razne bolesti. Listopadni pemfigus je najčešća bolest ove vrste. Obično se pojavljuje u dobi od 3 do 5 godina, a karakteriziraju ga vezikularne erupcije na koži oko očiju, nosa i usana. Zatim se vezikule rasprsnu u ravne čireve. Predisponirani za ovu bolest su, između ostalih akita, doberman, jazavčar, border collie, newfoundland i labrador. Njegova varijanta je pemphigus erythematosus, koji uzrokuje simetrične promjene na koži na glavi i ušima, koje se pojačavaju ljeti. Često njemački i škotski ovčari pate od toga. Zauzvratpemphigus vulgaris se manifestira kao pustule, žuljevi i erozije na mjestima gdje koža prelazi u sluznicu i u samim membranama (npr. usta, nosnice, kapci). Čak može doći do upale i gubitka kandži. To je neizlječiv oblik pemfigusa. Njezin je tip ljuljajući pemfigus, s karakterističnim papilarnim lezijama koje se pretvaraju u kraste - najčešće na ušima, ponekad na prtljažniku.
Fokalni eritematozni lupus obično ne proizvodi sistemske simptome, već je ograničen na kožu usta koja je crvena i ljuskasta. Intenzivira se ljeti i tada dolazi do promjene boje nosnog zrcala koja pukne i pukne. Koliji su posebno osjetljivi na lupus.
Sindrom Voght-Koyanagi-Harada karakterizira promjena boje kože i kose i uveitis (koji može dovesti do sljepoće). Najčešći je kod pasa Akita Inu, ali ga ima i u Setteru, Goldensu, Samoyedsu, Bernardincima i Shetlandersima.
Zauzvrat , eozinofilni sindrom sastoji se od nekoliko bolesti koje uključuju: eozinofilni disk (koža trbuha i bedara prekrivena je žuto-narančastim lezijama), eozinofilni granulom (čvorići i čirevi se razvijaju u ustima i stražnjim nogama) i eozinofilni čir (koža na mjestu lezije). - najčešće na gornjoj usni - ispupčena je, crvena i vlažna).
Mišićna slabost javlja se naročito kod španjela, lisica terijera i Jack Russell terijera. Glavni simptom je slabost životinje, brzi umor, nestabilan hod, slabost zadnjih udova, izlijevanje hrane odmah nakon jela.
Eozinofilni miozitis najčešće se javlja kod njemačkih ovčara, rotvajlera i dobermana. Karakterizira ga upala mišićnih mišića - pas ne može zatvoriti ili otvoriti usta. Dijagnoza ovih stanja temelji se na razgovoru s vlasnikom kućnog ljubimca, kliničkim testovima, pretragama krvi i alergijskim testovima. Međutim, histopatološki pregled je presudan. Liječenje je dugo i često zahtijeva doživotne lijekove.